La Superintendencia Nacional de Salud ha redistribuido sus sedes y jurisdicciones en el territorio nacional, con el objetivo de garantizar la oportuna y eficaz prestación del servicio de salud. La reorganización también está justificada por la expansión en el espectro de los vigilados e implementar la desconcentración administrativa, figura definida por la Corte Constitucional.
Adicionalmente, los cambios en las jurisdicción del ente de vigilancia y control también surge para dar cumplimiento a la Sentencia T– 302 de 2017, en la que se ordena “(…) Fortalecer las actividades de inspección, vigilancia y control por parte de la Superintendencia Nacional de Salud, en el contexto particular y específico de La Guajira (…)”.
Cabe anotar que, hasta antes de las modificaciones, la estructura de la Superintendencia Nacional de Salud actualmente tiene ocho (08) Direcciones Regionales, a saber, Norte, Caribe, Andina, Nororiental, Occidental Sur, Orinoquia y Chocó, las cuales se encuentran adscritas al Despacho del Superintendente Delegado para Entidades Territoriales y Generadores, Recaudadores y Administradores de Recursos del Sistema General de Seguridad Social en Salud, de acuerdo a las necesidades del servicio existentes.
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Así quedó la distribución, jurisdicción y sedes de la Superintendencia
De acuerdo con la Resolución 2023500020000093 – 6, expedida el 13 de enero de 2023, la distribución de sedes y jurisdicciones quedó de la siguiente manera:
| Dirección Regional | Sede | Jurisdicción |
| Dirección Regional Norte | Barranquilla – Distrito Especial,Industrial y Portuario | Atlántico Bolívar Sucre Córdoba San Andrés |
| Dirección Regional Caribe | Riohacha | La Guajira Magdalena Cesar |
| Dirección Regional Andina | Medellín | Antioquia Caldas Quindío Risaralda |
| Dirección Regional Nororiental | Bucaramanga | Boyacá Norte de Santander Santander |
| Dirección Regional Occidental | Santiago de Cali | Cauca Nariño Valle del Cauca |
| Dirección Regional Sur | Neiva | Caquetá Huila Putumayo Tolima |
| Dirección Regional Orinoquía | Yopal | Meta Casanare Guainía Guaviare Vaupés Arauca Vichada |
| Dirección Regional Chocó | Quibdó | Chocó |
Las Entidades Territoriales de Cundinamarca, Amazonas y Distrito Capital de Bogotá estarán a cargo de la sede nacional de la Superintendencia – delegatura de entidades territoriales, generadores, recaudadores y administradores de recursos del SGSSS.
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